Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms