Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TDRD12Q587J7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms