Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RTL8BQ17RB0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL8BQ17RB0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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