Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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