Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HIF1AQ16665 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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