Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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