Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITSN1Q15811 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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