Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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BRD3Q15059 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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