Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms