Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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TRAF1Q13077 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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