Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms