Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX10Q12887 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX10Q12887 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX10Q12887 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms