Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBQ06643 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms