Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms