Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLCB3Q01970 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms