Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC10Q01780 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC10Q01780 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms