Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRX1P78414 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRX1P78414 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRX1P78414 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms