Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJA9P57773 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJA9P57773 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GJA9P57773 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms