Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms