Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BACE1P56817 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BACE1P56817 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BACE1P56817 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms