Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB28P51157 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB28P51157 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms