Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC1A3P43003 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms