Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CBP42338 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms