Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJC1P36383 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms