Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNASE4P34096 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNASE4P34096 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms