Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms