Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms