Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms