Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPGDP15428 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPGDP15428 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPGDP15428 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPGDP15428 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPGDP15428 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPGDP15428 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPGDP15428 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms