Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRYBA1P05813 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRYBA1P05813 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms