Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1AO95602 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms