Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD6O43541 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms