Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3AO14802 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3AO14802 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms