Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-1B6SEH8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms