Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
B4DXG7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
B4DXG7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms