Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SNX13Q9Y5W8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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