Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNQ9UQP3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms