Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms