Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VTI1BQ9UEU0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms