Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms