Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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