Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL28Q9NXS3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL28Q9NXS3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms