Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms