Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP29Q9HBJ7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP29Q9HBJ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms