Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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FOXQ1Q9C009 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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