Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAPERQ9BY12 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms