Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL3Q9BXA9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms