Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRMT61BQ9BVS5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms