Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UTP23Q9BRU9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms