Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN5Q99471 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PFDN5Q99471 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms